Educación Ambiental es la unidad operativa de la Fundación, se encarga de producir materiales y equipamientos educativos relacionados con la educación ambiental, para impartir enseñanza tanto en el Museo con sede fija, como para el Museo Maleta, móvil, itinerante que visitará las comunidades indígenas y campesinas, y, a escuelas rurales y urbanas.